מסננת מולקולרית זאוליטיש השפעה חזקה על הפרדה על חנקן וחמצן.יש לו מבנה ומאפיינים של גביש, פני השטח הם שלד מוצק, והחללים הפנימיים יכולים לשחק את התפקיד של ספיחה של מולקולות.ישנן נקבוביות המחוברות זו לזו בין החללים, ומולקולות עוברות דרך הנקבוביות.בשל האופי הנקי של הנקבוביות, חלוקת גודל הנקבוביות של המסננת המולקולרית היא אחידה מאוד.מסננות מולקולריות סופחות מולקולות באופן סלקטיבי על סמך גודל הנקבוביות בתוך הגבישים שלהן, כלומר סופגות מולקולות בגודל מסוים תוך דחיית מולקולות של חומרים גדולים יותר.